O Laboratório Cristália vem sendo anualmente reconhecido com premiações que o consolidam como o laboratório farmacêutico mais inovador do Brasil:
Por sua excelência na Inovação Tecnológica em Química, o Cristália recebeu o "Prêmio SBQ de Inovação - Fernando Galembeck". Esta é a primeira vez que o título é concedido a uma empresa. Até então, somente Instituições, Centro de Pesquisas e Universidades tinham recebido o título. A honraria não é outogarda anualmente; ela ocorre sempre que a SBQ pretende chamar a atenção para um desenvolvimento do setor químico e farmacêutico do país.
O Laboratório Cristália foi contemplado na como empresa mais inovadora do País (categoria grande empresa) pela Sociedade Brasileira Pró-Inovação Tecnológica (Protec), em conjunto com o Serviço Nacional de Aprendizagem Industrial (Senai).
II Prêmio de Excelência em Gestão da Saúde e Segurança do Trabalho, instituído pelo Sindicato da Indústria Farmacêutica no Estado de São Paulo (Sindusfarma).
A Financiadora de Estudos e Projetos (Finep), empresa pública vinculada ao Ministério da Ciência e Tecnologia, reconheceu os investimentos e esforços do Cristália na pesquisa, desenvolvimento, produção e comercialização de medicamentos e produtos que contribuem para a saúde humana e o bem-estar da sociedade.
Iniciativa do Ministério do Desenvolvimento, Indústria e Comércio Exterior (MDIC), Confederação Nacional da Indústria (CNI) e Serviço Brasileiro de Apoio às Micro e Pequenas Empresas (Sebrae). A premiação reconhece os empresários empreendedores, que contribuem para o desenvolvimento tecnológico e industrial do país, gerando riqueza e distribuição de renda.